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聚类分析软件,聚类分析软件中文免费版下载-安卓软件下载
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聚类分析软件,聚类分析软件中文免费版下载

聚类分析软件,聚类分析软件中文免费版下载

介绍

聚类分析软件绿色版是一款非常好用的物品等位基因频率分析工具,该软件功能强大,如物品杂合度,信息含量等等进行分析计算,还可以将计算截图以图形的方式展现出来,让用户能够更好的进行研究分析。聚类分析软件这款软件能够计算分析的内容也是非常的多,如欧氏距离,多态性,遗传距离,聚类计算等等,非常方便。有需要的朋友赶紧来下载这款软件吧。

聚类分析软件最新版这款软件操作方式简单,没有任何难度,再加上可视化的功能栏,用户可以轻松找到需要的功能按键并进行使用。

聚类分析软件功能介绍

1、定义矩阵

定义数据矩阵的大小,用“长×宽”表示,X轴方向为品种,Y轴为数据;分类数(位点数)只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入,系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”,即表示有5个品种,4行数据,2个基因位点。系统最多支持255个品种,9999条数据。

2、输入数据

按定义的矩阵创建一个空白矩阵,若没有定义矩阵大小,则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

3、读入数据

将通过“保存矩阵”命令保存到磁盘上的数据读入到系统,系统将自动创建一个大小与之相适应的矩阵,并将全部数据读入。

4、追加数据

在当前矩阵的尾部继续添加一个已保存的数据,主要用于计算遗传距离。

5、读入遗传距离

将保存到磁盘上的遗传距离数据读入,可直接用于聚类计算。

6、数据正规化

将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意:点此命令后,在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据,再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

7、计算杂合度

按照Nei氏公式(1974)计算出各品种的杂合度。

8、计算多态性

按照Nei氏公式(1974)计算出各品种的多态信息含量。

9、计算欧氏距离

在将各数据读入到系统后,可用此命令按照Roger公式计算出各品种之间的遗传距离。注:如未在“定义矩阵”中定义分类数(等位基因数),则系统默认其值为1。在此情况下计算得出的遗传距离与使用Mahalanobis公式计算的遗传距离是一样的。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

10、计算遗传距离

在将各数据读入到系统后,可用此命令按照Nei氏公式(1983)计算出各品种之间的遗传距离。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

11、进行聚类计算

在已计算或读入遗传距离后,可用此命令按P.H.A.Sneath等(1973)的类平均聚类法(UPGMA法,又称非加权算术平均数成对聚类法)进行系统聚类。聚类结果说明:第1列No为序列号,代表是第几次聚类;第2列D为距离系数;第3、4列breed1、breed2为参于聚类的两个品种,第5列Cluster为聚类后的新名称,第6列Content为两品种的名称。未注册用户最后3次聚类结果不显示。

12、查看原始数据

将原始数据读入到当前矩阵中。并清除正规化处理过的数据。

13、查看遗传距离

将读入的遗传距离或经过计算得到的遗传距离在当前矩阵中显示。

14、查看聚类图

按照聚类后的结果自动画出聚类图。

15、保存聚类图

将显示的聚类图以图象文件保存到磁盘上。未注册用户无此功能!

16、保存矩阵

将当前矩阵保存到磁盘上。若当前矩阵为原始数据,则保存原始数据;若为经过正规化处理过的数据,则保存经过处理的数据;若为杂合度,则保存杂合度;。。。。。。;若为聚类结果,则保存聚类结果。未注册用户无此功能!

17、数据导出

系统自动判断当前所有矩阵中所含的数据,并将其导出为Excel文件。未注册用户无此功能!

聚类分析软件安装步骤

1、在本站下载聚类分析软件官方版这款软件的压缩包,解压后,双击exe,进入安装界面,点击下一步

聚类分析软件安装步骤1

2、设置软件安装位置,点击浏览可以修改默认在C盘的安装位置,建议大家选择安装在D盘,然后点击下一步

聚类分析软件安装步骤2

3、选择持续文件夹,默认即可,点击下一步

聚类分析软件安装步骤3

4、选择是否创建软件快捷方式,选择是,点击下一步

聚类分析软件安装步骤4

5、确认软件安装信息,点击下一步

聚类分析软件安装步骤5

6、聚类分析软件官方版软件正在安装,等待完成即可

聚类分析软件安装步骤6

聚类分析软件使用方法

1、安装完成点击桌面上的软件打开,界面如图所示。

聚类分析软件使用方法1

2、点击定义矩阵,可以在这里控制数据的矩阵,定义数据矩阵的大小,用“长×宽”表示,X轴方向为品种,Y轴为数据;分类数(位点数)只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入,系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”,即表示有5个品种,4行数据,2个基因位点。系统最多支持255个品种,9999条数据。

聚类分析软件使用方法2

聚类分析软件使用方法3

3、输入数据,将您的分析数据文件导入软件中进行分析,按定义的矩阵创建一个空白矩阵,若没有定义矩阵大小,则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

聚类分析软件使用方法4

4、数据正规化,可以将数据自动排版,将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意:点此命令后,在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据,再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

聚类分析软件使用方法5

5、计算命令,您可以通过鼠标点击不同的计算项目进行数据分析,具有计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离、进行聚类计算

聚类分析软件使用方法6

6、数据查看及保存命令、查看原始数据、查看遗传距离、保存聚类图、保存矩阵、数据导出

聚类分析软件使用方法7

聚类分析软件常见问题

一.如何定义矩阵?

1、运行软件,点击“定义矩阵”

聚类分析软件常见问题1

2、设置矩阵大小

聚类分析软件常见问题2

3、点击确定即可

聚类分析软件常见问题3

二.如何查看聚类分析软件官方版的帮助文件?

在聚类分析软件官方版软件主页点击“帮助”即可快速查看帮助文件

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详细信息

软件语言   简体中文
     
更新时间   2020年12月17日
     
文件大小   3.0M
     
软件系统   Win All
     
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